• manajer kepelabuhan, Ahli Madya Teknika & Nautika yang profesional

• Perwira Pelaut (Ahli Teknika Tingkat III & Ahli Nautika Tingkat III) sesuia tuntutan dunia kemaritiman.

Secara berkelenjutan terus meningktakan mutu pendidikannya dengan mengacu pada standar yang ditetapkan oleh International Maritime Organization (IMO) dan telah diterimanya APPROVAL (Pengesahan) lima tahun yang kedua dari Dirjen Perla tanggal 4 Agustus 2008 Nomor : ph.34/2/18/DJPL-08 untuk prodi Teknika, dan nomor : ph.34/2/19/DJPL-08 untuk prodi Nautika

Akademi Maritim Yogyakarta mengelola tiga jurusan Jenjang DIII (Ahli Madya) masing-masing:

• Jurusan Ketatalaksanaan Pelayaran Niaga (KPN), terakreditasi A
  

• Jurusan teknika, terakreditasi B dan Standar Internasional (IMO)

• Jurusan nautika, terakreditasi B dan Standar Internasional (IMO)

Disamping ijazah DIII, khusus untuk Jurusan teknika dan Nautika setelah lulus ujian DIII/ setelah semester IV dapat menempuh Ujian Negara Profesi Kelautan yang diselenggarakan oleh Dewan Penguji keahlian Pelaut (DPKP) untuk mendapatkan sertifikat dengan Predikasi Ahli teknika Tingkat III (ATT-III) dan Ahli nautika Tingkat III (ANT-III).